RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 SFTA2Q6UW10 78 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 C9orf118A6NHY6 69 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 MAJINQ3KP22 176 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 NMUP48645 174 aa7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 HERV-K104P63124 156 aa7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 GAGE2BQ13066 116 aa7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 PFN2P35080 140 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP10-8P60410 259 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 PYY3Q5JQD4 70 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.2□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF815PA8K554 130 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00587B1AMM8 73 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 GAGE2EQ4V326 116 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 SVIPQ8NHG7 77 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 VAMP8Q9BV40 100 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 ERG28Q9UKR5 140 aa7.19□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 A0A096LNI7 61 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 A0A0U1RRA0 63 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00158P58513 81 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.18□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 SMIM13P0DJ93 91 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 PTTG1IPP53801 180 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 COX17Q14061 63 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 SPATA45Q537H7 98 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 Q6ZRP5 223 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 PCP2Q8IVA1 136 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.17□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 REG3GQ6UW15 175 aa7.16□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 A0A0J9YXY3 114 aa7.15□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 S100A12P80511 92 aa7.15□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.15□□□□□ -1.26
GARNL3-217ENST00000481875 RNF213Q63HN8 5207 aa7.14□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.14□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 COX8AP10176 69 aa7.13□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.13□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 C14orf144Q96I85 54 aa7.13□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.12□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 TIMM17BO60830 172 aa7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 SMIM6P0DI80 62 aa7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 DAND5Q8N907 189 aa7.11□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1W2PNN7 141 aa7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM238C9JI98 176 aa7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.1□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 FAM168BA1KXE4 195 aa7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 DLEU1O43261 78 aa7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.09□□□□□ -1.27
GARNL3-217ENST00000481875 NPC2P61916 151 aa7.08□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 LITAFQ99732 161 aa7.08□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 B5MCH6 92 aa7.07□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.07□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 Q6ZVH6 145 aa7.06□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.06□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.06□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 COPS9Q8WXC6 57 aa7.06□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.06□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 SPANXCQ9NY87 97 aa7.06□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 M0QXV9 152 aa7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 IFITM1P13164 125 aa7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 C12orf57Q99622 126 aa7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 C22orf24Q9Y442 160 aa7.05□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 VPREB1P12018 145 aa7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 HIST1H4GQ99525 98 aa7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 PRO1933Q9H354 126 aa7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 HIGD1BQ9P298 99 aa7.04□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.03□□□□□ -1.28
GARNL3-217ENST00000481875 GAGE10A6NGK3 116 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.6 ms