RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, human

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDZK1-204	ENST00000443667	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	AMELX	Q99217	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	VCX2	Q9H322	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	MT1F	P04733	61 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	NPS	P0C0P6	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	RAB5A	P20339	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	HERVK_113	P63121	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	CEBPG	P53567	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF345	Q14585	488 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667		V9GYV3	84 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDZK1-204	ENST00000443667	ATP5L	O75964	103 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	SEC11A	P67812	179 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	PRY	O14603	147 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	SPRR1A	P35321	89 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	NCR3	O14931	201 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	PPBP	P02775	128 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PDZK1-204	ENST00000443667	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667		F8W036	122 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667		Q8N8P6	123 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667		Q9BRP9	147 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667		A0A0U1RRA0	63 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667		A0A1B0GW15	77 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667		H7C2G1	150 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667		A0A1B0GXF2	115 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	C20orf202	A1L168	122 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	TRIAP1	O43715	76 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	COX17	Q14061	63 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	S100A8	P05109	93 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	LINC00158	P58513	81 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	ADIRF	Q15847	76 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PDZK1-204	ENST00000443667		H3BRM9	83 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PDZK1-204	ENST00000443667		Q6ZRX8	168 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PDZK1-204	ENST00000443667		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
PDZK1-204	ENST00000443667	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PDZK1-204	ENST00000443667	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
PDZK1-204	ENST00000443667	PMVK	Q15126	192 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PDZK1-204	ENST00000443667	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PDZK1-204	ENST00000443667	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PDZK1-204	ENST00000443667	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71

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