RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 C15orf56Q8N910 161 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 LYSTQ99698 3801 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 S100A12P80511 92 aa6.41□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 RNF151Q2KHN1 245 aa6.41□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.41□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.41□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 E9PLD3 99 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 J3QQQ9 107 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 COX17Q14061 63 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 DPH3Q96FX2 82 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 VAMP8Q9BV40 100 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 ATOH7Q8N100 152 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 COPS9Q8WXC6 57 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 C16orf90A8MZG2 172 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 FAM229AH3BQW9 127 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 STPG4Q8N801 248 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.37□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 WFDC2Q14508 124 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 KIAA0087Q14695 138 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZRU5 148 aa6.36□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF815PA8K554 130 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00158P58513 81 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 C2orf82Q6UX34 121 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 ERG28Q9UKR5 140 aa6.35□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM238C9JI98 176 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM6P0DI80 62 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 PFN2P35080 140 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 SPATA45Q537H7 98 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 GAGE2BQ13066 116 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 TIMM17BO60830 172 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP10-2P60368 255 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 GAGE2EQ4V326 116 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZVH6 145 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.31□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1B0GVY2 172 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 PTTG1IPP53801 180 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 PYY3Q5JQD4 70 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 C10orf25Q5T742 122 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.3□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 A0A0J9YXY3 114 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 DLEU1O43261 78 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 SLPIP03973 132 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 COX8AP10176 69 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 MAJINQ3KP22 176 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.29□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM13P0DJ93 91 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 LCE2CQ5TA81 110 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.28□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.27□□□□□ -1.4
CTPS1-210ENST00000486889 A0A0U1RRA0 63 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 IFITM1P13164 125 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZRP5 223 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 KMT2AQ03164 3969 aa6.27□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 A0A096LNI7 61 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 TSTD3H0UI37 97 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01620Q4KN68 170 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 PCP2Q8IVA1 136 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 C7orf33Q8WU49 177 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 C14orf144Q96I85 54 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.26□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H4GQ99525 98 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 SPANXCQ9NY87 97 aa6.25□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.24□□□□□ -1.41
CTPS1-210ENST00000486889 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.24□□□□□ -1.41
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