RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FGF6P10767 208 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.46□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUPR1O60356 82 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CHTF8P0CG12 524 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MT1HL1P0DM35 61 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FOXI1Q12951 378 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CFAP161Q6P656 301 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.45□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC01546A6NGU7 62 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 I3L3M4 83 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TSHBP01222 138 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC00614P0C842 121 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRSS47A8MTI9 375 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 K7EMI3 77 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SCGB1D1O95968 90 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DDTP30046 118 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CTAG1AP78358 180 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 Q6ZRU5 148 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PPP1R17O96001 155 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 COX6A2Q02221 97 aa9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PET117Q6UWS5 81 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MRAP2Q96G30 205 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRELID3AQ96N28 172 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 VAMP8Q9BV40 100 aa9.41□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC01549A6NIU2 74 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LEPROTL1O95214 131 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C3orf79P0CE67 100 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FA2HQ7L5A8 372 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ST20Q9HBF5 79 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.4□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC00587B1AMM8 73 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 D6R8Y8 96 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CKS2P33552 79 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KRTDAPP60985 99 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AMN1Q8IY45 258 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NRACQ8N912 160 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DPH3Q96FX2 82 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CCL25O15444 150 aa9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 XCL1P47992 114 aa9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM101Q96IK0 257 aa9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.37□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A0A096LNI7 61 aa9.36□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.36□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HBDP02042 147 aa9.36□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.36□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 VCYO14598 125 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MAJINQ3KP22 176 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C20orf78Q9BR46 151 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LRP2P98164 4655 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SMKR1H3BMG3 65 aa9.34□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 G0S2P27469 103 aa9.34□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC01545Q5VT33 79 aa9.34□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.34□□□□□ -0.91
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SS18Q15532 418 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 STPG4Q8N801 248 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 Q8N8P6 123 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C7orf33Q8WU49 177 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TNFRSF6BO95407 300 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NPYP01303 97 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FAM104AQ969W3 186 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C14orf144Q96I85 54 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TCAPO15273 167 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CARD19Q96LW7 228 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FCER1GP30273 86 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms