RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590301.1

NPC1-208, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 2

Gene NPC1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1B0GUT8	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301		I3L3M4	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301		C9JQL5	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	PPP1R17	O96001	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	FGF6	P10767	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	PMCH	P20382	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	CEBPG	P53567	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	ESD	P10768	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	RIG	Q13278	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1B0GW15	77 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	PANO1	I0J062	215 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	VCY	O14598	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	CCL25	O15444	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	TSHB	P01222	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	SLPI	P03973	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	RAB4A	P20338	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	FOXI1	Q12951	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NPC1-208	ENST00000590301		A0A087WYN8	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	TCAP	O15273	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	FCER1G	P30273	86 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	XCL1	P47992	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	SS18	Q15532	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301		Q6ZRU5	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301		V9GYV3	84 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	COX6A2	Q02221	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301		A0A0A0MQY5	61 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	S100A8	P05109	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	PEA15	Q15121	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	ADIRF	Q15847	76 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	NRAC	Q8N912	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NPC1-208	ENST00000590301	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms