RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZRP5 223 aa5.81□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 I3L3M4 83 aa5.8□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 TSHBP01222 138 aa5.8□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 ESDP10768 282 aa5.8□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 SYCNQ0VAF6 134 aa5.8□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.8□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX261Q6UWH6 196 aa5.8□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.8□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM101Q96IK0 257 aa5.8□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 BTF3L4Q96K17 158 aa5.8□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 PMCHP20382 165 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 PTTG1IPP53801 180 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 OCC1Q8TAD7 63 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 MRAP2Q96G30 205 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.79□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 CAMPP49913 170 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 GAGE2BQ13066 116 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.78□□□□□ -1.48
SMARCE1-210ENST00000481231 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PNN7 141 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 SS18Q15532 418 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 ST20Q9HBF5 79 aa5.77□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.76□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.76□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 A8MWL6 223 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 COX7A2LO14548 114 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 APOMO95445 188 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 MALP21145 153 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR4Q16378 134 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 CT83Q5H943 113 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 NUP35Q8NFH5 326 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 ISOC2Q96AB3 205 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM210AQ96ND0 272 aa5.75□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 MT-ND6P03923 174 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC51BQ86UW2 128 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.74□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GUT8 65 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 HIGD1CA8MV81 97 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM250H0YL14 139 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 SMKR1H3BMG3 65 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB4AP20338 218 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf137Q5JT78 98 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 C5orf38Q86SI9 138 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 AMN1Q8IY45 258 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 BORCS7Q96B45 105 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 C2orf48Q96LS8 159 aa5.73□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 VCYO14598 125 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 FCER1GP30273 86 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 SPAG11BQ08648 103 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZUT4 128 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 TSKUQ8WUA8 353 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SMARCE1-210ENST00000481231 CEBPGP53567 150 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 NRACQ8N912 160 aa5.71□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV7-43P04211 117 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF151Q2KHN1 245 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01551Q86U37 167 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 DIRC1Q969H9 104 aa5.7□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM168BA1KXE4 195 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 LCE2BO14633 110 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1R17O96001 155 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DL4Q99706 377 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 OSTCQ9NRP0 149 aa5.69□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087WZ39 114 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 H0Y9J4 135 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 RIGQ13278 110 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 C10orf25Q5T742 122 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.68□□□□□ -1.5
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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