RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 ESDP10768 282 aa5.3□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXI1Q12951 378 aa5.3□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.3□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 BIN3Q9NQY0 253 aa5.3□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.3□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.29□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 H7C423 109 aa5.29□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGF6P10767 208 aa5.29□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A1P23297 94 aa5.29□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A12P80511 92 aa5.29□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCE1DQ5T752 114 aa5.29□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.29□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM250H0YL14 139 aa5.28□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSHBP01222 138 aa5.28□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 APCSP02743 223 aa5.28□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.28□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.28□□□□□ -1.56
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.27□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.27□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 CT83Q5H943 113 aa5.27□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.27□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.27□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 A8MWL6 223 aa5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 I3L3M4 83 aa5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCL25O15444 150 aa5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCP4P48539 62 aa5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKAP14Q86UN6 197 aa5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 STPG4Q8N801 248 aa5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01600Q96MT4 127 aa5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.26□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.25□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 A4D1N5 150 aa5.25□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIGD1CA8MV81 97 aa5.25□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB4AP20338 218 aa5.25□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 PMCHP20382 165 aa5.25□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 XCL1P47992 114 aa5.25□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEX261Q6UWH6 196 aa5.25□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01551Q86U37 167 aa5.25□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 AMN1Q8IY45 258 aa5.25□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMKR1H3BMG3 65 aa5.24□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP10-8P60410 259 aa5.24□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB14P61106 215 aa5.24□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRACQ8N912 160 aa5.24□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSKUQ8WUA8 353 aa5.24□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM104AQ969W3 186 aa5.24□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPH3Q96FX2 82 aa5.24□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 V9GYV3 84 aa5.24□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 LPAP08519 4548 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GUT8 65 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 GHRHP01286 108 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 BLOC1S1P78537 153 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 C7orf33Q8WU49 177 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRAP2Q96G30 205 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 CARD19Q96LW7 228 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST20Q9HBF5 79 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 OSTCQ9NRP0 149 aa5.23□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0J9YXV3 536 aa5.22□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PNN7 141 aa5.22□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.22□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEBPGP53567 150 aa5.22□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFA5Q16718 116 aa5.22□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.22□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUP35Q8NFH5 326 aa5.22□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 BTF3L4Q96K17 158 aa5.22□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.22□□□□□ -1.57
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.21□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTTG1IPP53801 180 aa5.21□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYCNQ0VAF6 134 aa5.21□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 SS18Q15532 418 aa5.21□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZUT4 128 aa5.21□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 ISOC2Q96AB3 205 aa5.21□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM101Q96IK0 257 aa5.21□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF727A8MUV8 499 aa5.2□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9JQL5 133 aa5.2□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 CAMPP49913 170 aa5.2□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
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