RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424428.1

SLIT1-AS1-201, SLIT1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLIT1-AS1, Length 689 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.14□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 A0A087WYN8 130 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 A0A1B0GW15 77 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LINC00862A6NCI5 91 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ZNF727A8MUV8 499 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HIGD1CA8MV81 97 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PPP1R2P9O14990 202 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SLPIP03973 132 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RIGQ13278 110 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LCE3BQ5TA77 95 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LINC01551Q86U37 167 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 C15orf56Q8N910 161 aa5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RAB4AP20338 218 aa5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TMEM18Q96B42 140 aa5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.12□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PANO1I0J062 215 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TSHBP01222 138 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 S100A8P05109 93 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 FCER1GP30273 86 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CEBPGP53567 150 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 COX6A2Q02221 97 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 FOXI1Q12951 378 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ISOC2Q96AB3 205 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 KIR2DL4Q99706 377 aa5.11□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.1□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.1□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 F8WDY8 70 aa5.1□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 C20orf78Q9BR46 151 aa5.1□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.1□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.1□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 APOMO95445 188 aa5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 XCL1P47992 114 aa5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 MAJINQ3KP22 176 aa5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 STPG4Q8N801 248 aa5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 NUP35Q8NFH5 326 aa5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 C2orf48Q96LS8 159 aa5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 V9GYV3 84 aa5.09□□□□□ -1.59
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 F8W036 122 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 COX7A2LO14548 114 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PPBPP02775 128 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 MALP21145 153 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SYCNQ0VAF6 134 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PEA15Q15121 130 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 AMN1Q8IY45 258 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CARD19Q96LW7 228 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 NAT8Q9UHE5 227 aa5.08□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.07□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.07□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.07□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PHOX2AO14813 284 aa5.07□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CHTF8P0CG12 524 aa5.07□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 RNF151Q2KHN1 245 aa5.07□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.07□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.07□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.06□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CKS2P33552 79 aa5.06□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 CAMPP49913 170 aa5.06□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 REG3GQ6UW15 175 aa5.06□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 Q6ZRP5 223 aa5.06□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 NRACQ8N912 160 aa5.06□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.06□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 LINC01600Q96MT4 127 aa5.06□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.06□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 A0A096LNI7 61 aa5.05□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 GAS8-AS1O95177 125 aa5.05□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 MT1HL1P0DM35 61 aa5.05□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ADIRFQ15847 76 aa5.05□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.05□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.04□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 TNFRSF6BO95407 300 aa5.04□□□□□ -1.6
SLIT1-AS1-201ENST00000424428 PTTG1IPP53801 180 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms