RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		12.37	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902		H3BNG1	76 aa		12.37	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902		H3BVH4	76 aa		12.37	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	CENPW	Q5EE01	88 aa		12.37	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		12.36	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		12.36	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	GNG4	P50150	75 aa		12.36	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	CRYBA4	P53673	196 aa		12.36	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		12.36	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	MLST8	Q9BVC4	326 aa		12.36	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		12.35	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902		M0R2N4	97 aa		12.35	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		12.35	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	LINC01559	Q495D7	138 aa		12.35	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	IL36B	Q9NZH7	164 aa		12.35	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		12.35	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		12.34	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902		A0A096LPF7	62 aa		12.34	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		12.34	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		12.34	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		12.33	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		12.33	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	SYT8	Q8NBV8	401 aa		12.33	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		12.33	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		12.33	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	RS1	O15537	224 aa		12.32	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	CEBPG	P53567	150 aa		12.32	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	TOR2A	Q5JU69	321 aa		12.32	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		12.32	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	PTH2	Q96A98	100 aa		12.32	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902		M0R381	172 aa		12.31	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	GYPE	P15421	78 aa		12.31	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	ESRG	Q1W209	222 aa		12.31	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		12.31	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902		A8MWV9	139 aa		12.3	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	IGLV2-8	P01709	118 aa		12.3	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	TEX261	Q6UWH6	196 aa		12.3	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		12.29	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	CIDEA	O60543	219 aa		12.29	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	SRI	P30626	198 aa		12.29	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	ZNF575	Q86XF7	245 aa		12.29	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	SMIM12	Q96EX1	92 aa		12.29	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	JPT2	Q9H910	190 aa		12.29	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	BIN3	Q9NQY0	253 aa		12.29	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	TMEM250	H0YL14	139 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902		K7EQD1	137 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	SST	P61278	116 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	ZFP82	Q8N141	532 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	PARL	Q9H300	379 aa		12.28	□□□□□ -0.44
USP19-210	ENST00000465902	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		12.27	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902		P01737	135 aa		12.27	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		12.27	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		12.27	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	FAM210A	Q96ND0	272 aa		12.27	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		12.27	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		12.27	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		12.26	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		12.26	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	CXCL1	P09341	107 aa		12.26	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	MED14OS	P0DP75	135 aa		12.26	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	GZMB	P10144	247 aa		12.26	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	RHOH	Q15669	191 aa		12.26	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	TPPP3	Q9BW30	176 aa		12.26	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		12.26	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902		Q9H8V8	135 aa		12.26	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902		A0A087WWL8	130 aa		12.25	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		12.25	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		12.25	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		12.25	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		12.25	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		12.25	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	OCC1	Q8TAD7	63 aa		12.25	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	XKRY2	A2RUG3	117 aa		12.24	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		12.24	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	SFRP2	Q96HF1	295 aa		12.24	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		12.23	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	RHOD	O00212	210 aa		12.23	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZSN1	163 aa		12.23	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		12.23	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	NUDT11	Q96G61	164 aa		12.23	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		12.23	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902		K7EN84	100 aa		12.22	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	SNAI2	O43623	268 aa		12.22	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	NXPH4	O95158	308 aa		12.22	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	OR5AL1	P0C617	328 aa		12.22	□□□□□ -0.45
USP19-210	ENST00000465902	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		12.22	□□□□□ -0.45

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