RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 MUC21Q5SSG8 566 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 Q6ZVQ6 151 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 MARCH3Q86UD3 253 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 C10orf111Q8N326 155 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 OR1L1Q8NH94 360 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 OR1F12Q8NHA8 337 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 SEC22AQ96IW7 307 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 LINC01587Q99440 93 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 RNF126Q9BV68 326 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 MANBALQ9NQG1 85 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 MUC4Q99102 2169 aa3.58□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 K7EQG2 157 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 ISLRO14498 428 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 ATP5LO75964 103 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CA2P00918 260 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 HBE1P02100 147 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 GYPAP02724 150 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CECR9P0C854 216 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 C12orf73Q69YU5 71 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 OR4K13Q8NH42 304 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 LINC00477Q96M19 166 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 TM2D1Q9BX74 207 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 C1orf123Q9NWV4 160 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 FZR1Q9UM11 496 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.57□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 C5orf49A4QMS7 147 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 GGTLC3B5MD39 225 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 H3BUT2 72 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 SH2D1BO14796 132 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CXorf1O96002 111 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 IGHMP01871 453 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 IGLC6P0CF74 106 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 FCGR2CP31995 323 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 PRSS3P35030 304 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 GALR1P47211 349 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 SMIM11AP58511 58 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 KRTDAPP60985 99 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CCL8P80075 99 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 TGFBR3Q03167 851 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 ATP5G2Q06055 141 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CD226Q15762 336 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 NOXRED1Q6NXP6 359 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 Q6ZSR3 168 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 ARPC1AQ92747 370 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 UBE2E3Q969T4 207 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 NABP1Q96AH0 204 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 BORCS7Q96B45 105 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 AGMATQ9BSE5 352 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CST11Q9H112 138 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 C16orf95Q9H693 158 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.56□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 DSPPQ9NZW4 1301 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 DAPL1A0PJW8 107 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 PLPP1O14494 284 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 SOCS1O15524 211 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 ANGPTL7O43827 346 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 EFNA2O43921 213 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 NUPR1O60356 82 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 MPDU1O75352 247 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF737O75373 536 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 RENP00797 406 aa3.55□□□□□ -1.84
ATXN3-218ENST00000553309 CD28P10747 220 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms