RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659		U3KQK5	164 aa		12.05	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	RITA1	Q96K30	269 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	CCL19	Q99731	98 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		12.04	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659		A0A096LNJ9	63 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	HCP5	Q6MZN7	132 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	PATE2	Q6UY27	113 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	DPM3	Q9P2X0	92 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A17	O43808	307 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	LMO4	P61968	165 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	KLRD1	Q13241	179 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	GAGE13	Q4V321	117 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659	CEND1	Q8N111	149 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PPI3	338 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ODF3B	A8MYP8	253 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	FXYD2	P54710	66 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF479	Q96JC4	524 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	OTOR	Q9NRC9	128 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	FLNC	Q14315	2725 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	IGLL5	B9A064	214 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	WFDC2	Q14508	124 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	PCP2	Q8IVA1	136 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ORMDL3	Q8N138	153 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	TNC	P24821	2201 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	CRYGB	P07316	175 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	RNF5	Q99942	180 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	SIRPD	Q9H106	197 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659		Q9H3A6	140 aa		12	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659		E7EUB6	86 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	TIMM23	O14925	209 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	CNTFR	P26992	372 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	PRELID3A	Q96N28	172 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ZMAT4	Q9H898	229 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	GP9	P14770	177 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	EVI2A	P22794	236 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	PAX8	Q06710	450 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ETDB	Q3ZM63	59 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	AKAP6	Q13023	2319 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	TRGV9	Q99603	122 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ERG28	Q9UKR5	140 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	LINC01619	G3V211	115 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ATP5J2	P56134	94 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	CFHR4	Q92496	578 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ARPC1A	Q92747	370 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	PRO0461	Q9UI25	63 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	LINC01546	A6NGU7	62 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	APOM	O95445	188 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	COX6B1	P14854	86 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	MLANA	Q16655	118 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659		D6R8Y8	96 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	ATP5L	O75964	103 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	PRR31	Q5SQ13	230 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	SGK494	Q96LW2	274 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BBS1-225	ENST00000630659	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BBS1-225	ENST00000630659		H3BMG7	143 aa		11.96	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms