RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.59□□□□□ -1.19
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DDX39B-209ENST00000428450 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.57□□□□□ -1.2
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DDX39B-209ENST00000428450 IGLV2-8P01709 118 aa7.56□□□□□ -1.2
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DDX39B-209ENST00000428450 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 Q9HAA7 133 aa7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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DDX39B-209ENST00000428450 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.54□□□□□ -1.2
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DDX39B-209ENST00000428450 TERB2Q8NHR7 220 aa7.54□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.54□□□□□ -1.2
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DDX39B-209ENST00000428450 GAS8-AS1O95177 125 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 CD3DP04234 171 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 GYPEP15421 78 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 S100A7P31151 101 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 TCL1AP56279 114 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 OR1S1Q8NH92 325 aa7.53□□□□□ -1.2
DDX39B-209ENST00000428450 NAA60Q9H7X0 242 aa7.53□□□□□ -1.2
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