RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.39□□□□□ -1.39
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ITGB1-217ENST00000494395 FGL1Q08830 312 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGB1-217ENST00000494395 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ITGB1-217ENST00000494395 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGB1-217ENST00000494395 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGB1-217ENST00000494395 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGB1-217ENST00000494395 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.34□□□□□ -1.39
ITGB1-217ENST00000494395 XCL2Q9UBD3 114 aa6.34□□□□□ -1.39
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