RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395705.3

CTBP2-204, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-204	ENST00000395705	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	ATP6V1F	Q16864	119 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	AMTN	Q6UX39	209 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	PTTG1	O95997	202 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	PSG9	Q00887	426 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	RAB31	Q13636	194 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF738	Q8NE65	137 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705		H3BQ15	152 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	IGLC2	P0DOY2	106 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	MIF	P14174	115 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705		Q6ZRG5	221 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	MFF	Q9GZY8	342 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	MBD2	Q9UBB5	411 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	CELA1	Q9UNI1	258 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	PSG3	Q16557	428 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		12.08	□□□□□ -0.47
CTBP2-204	ENST00000395705	NUPR2	A6NF83	97 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705		M0R2Z0	102 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	MPDU1	O75352	247 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	FCN2	Q15485	313 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	S100A7A	Q86SG5	101 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	HSPB11	Q9Y547	144 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	RFNG	Q9Y644	331 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	PRAC2	D3DTV9	90 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	PFDN5	Q99471	154 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	PRM2	P04554	102 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	PYY	P10082	97 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	CXCL2	P19875	107 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	BAP18	Q8IXM2	172 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	ATP5S	Q99766	215 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	WFDC1	Q9HC57	220 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	NEU1	Q99519	415 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	RNF24	Q9Y225	148 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	JTB	O76095	146 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	PET100	P0DJ07	73 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705		Q5BKY6	102 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705		Q6ZTC4	211 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	MED28	Q9H204	178 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	NDUFB4	O95168	129 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	EMP1	P54849	157 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	KIR3DS1	Q14943	382 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	C12orf74	Q32Q52	190 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTBP2-204	ENST00000395705	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTBP2-204	ENST00000395705	RHOB	P62745	196 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTBP2-204	ENST00000395705	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
CTBP2-204	ENST00000395705	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTBP2-204	ENST00000395705	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTBP2-204	ENST00000395705	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTBP2-204	ENST00000395705		M0R3E3	92 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTBP2-204	ENST00000395705	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	12.01	□□□□□ -0.49

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