RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482962.5

ARF1-210, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARF1, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-210ENST00000482962 CITED4Q96RK1 184 aa11.1□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 ATP5SQ99766 215 aa11.1□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 ISLRO14498 428 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 B2MP61769 119 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 PRR20EP86478 221 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 PRR20CP86479 221 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 PRR20DP86480 221 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 PRR20BP86481 221 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 PRR20AP86496 221 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 PSMG4Q5JS54 123 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 STHQ8IWL8 128 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 ZNF709Q8N972 641 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 UHRF2Q96PU4 802 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11.09□□□□□ -0.63
ARF1-210ENST00000482962 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.08□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 MIC13Q5XKP0 118 aa11.08□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 LEMD1Q68G75 181 aa11.08□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.08□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 SLC39A9Q9NUM3 307 aa11.08□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 COL7A1Q02388 2944 aa11.07□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 IFNA5P01569 189 aa11.07□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 Q6ZWC4 215 aa11.07□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.07□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.07□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.07□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.07□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 A0A087X0K7 114 aa11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 SOCS3O14543 225 aa11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 SPP1P10451 314 aa11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 ZNF124Q15973 351 aa11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 PATE2Q6UY27 113 aa11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 C16orf92Q96LL3 132 aa11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 RSG1Q9BU20 258 aa11.06□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 CXCL2P19875 107 aa11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 ZNF266Q14584 549 aa11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 OR2T35Q8NGX2 323 aa11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 LINC00052Q96N35 136 aa11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 AQP10Q96PS8 301 aa11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 CSTL1Q9H114 145 aa11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 RPRMQ9NS64 109 aa11.05□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 LCN15Q6UWW0 184 aa11.04□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.04□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.04□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.04□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 HLA-DRB4P13762 266 aa11.03□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 DEFB135Q30KP9 77 aa11.03□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.03□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 RETNQ9HD89 108 aa11.03□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.03□□□□□ -0.64
ARF1-210ENST00000482962 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa11.02□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 KNCNA6PVL3 124 aa11.02□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 SPRY2O43597 315 aa11.02□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 GUK1Q16774 197 aa11.02□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.02□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.02□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.02□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 RNF183Q96D59 192 aa11.01□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.01□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 HRH4Q9H3N8 390 aa11.01□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.01□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 H3BMM0 161 aa11□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 IGLC2P0DOY2 106 aa11□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 FAM78BQ5VT40 261 aa11□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 CLUHP3Q96NS8 147 aa11□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 ZNF253O75346 499 aa10.99□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 FFAR4Q5NUL3 377 aa10.99□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 MORN5Q5VZ52 161 aa10.99□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 ZNF738Q8NE65 137 aa10.99□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 C17orf77Q96MU5 243 aa10.99□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa10.98□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 A0A0J9YX75 114 aa10.98□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 RHOBP62745 196 aa10.98□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 PDE6HQ13956 83 aa10.98□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 Q5BKY6 102 aa10.98□□□□□ -0.65
ARF1-210ENST00000482962 EDA2RQ9HAV5 297 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms