RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 OR5G3P0C626 314 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 HLA-DMBP28068 263 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZTC4 211 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 RNF182Q8N6D2 247 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 ZNF709Q8N972 641 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.98□□□□□ -0.81
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAME-209ENST00000439106 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
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PRAME-209ENST00000439106 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
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PRAME-209ENST00000439106 MGST2Q99735 147 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 ARV1Q9H2C2 271 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.95□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 PLP1P60201 277 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 SELENOTP62341 195 aa9.94□□□□□ -0.82
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PRAME-209ENST00000439106 IFITM3Q01628 133 aa9.94□□□□□ -0.82
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PRAME-209ENST00000439106 C12orf74Q32Q52 190 aa9.94□□□□□ -0.82
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PRAME-209ENST00000439106 C2orf50Q96LR7 162 aa9.94□□□□□ -0.82
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PRAME-209ENST00000439106 APLNQ9ULZ1 77 aa9.94□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 IGSF23A1L1A6 192 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 FNDC10F2Z333 226 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 H3BTX0 84 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 M0R2Z0 102 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 GOSR2O14653 212 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 PRR20EP86478 221 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 PRR20CP86479 221 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 PRR20DP86480 221 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 PRR20BP86481 221 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 PRR20AP86496 221 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 RAB32Q13637 225 aa9.93□□□□□ -0.82
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PRAME-209ENST00000439106 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 AMTNQ6UX39 209 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 ZNF546Q86UE3 836 aa9.93□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 C11orf94C9JXX5 98 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 UPK1BO75841 260 aa9.92□□□□□ -0.82
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PRAME-209ENST00000439106 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 MIC13Q5XKP0 118 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 ZNF738Q8NE65 137 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 ENKURQ8TC29 256 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.92□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 A0A087X0K7 114 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 COX7A2P2O60397 106 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 CXCL3P19876 107 aa9.91□□□□□ -0.82
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