RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248948.3

VPREB3-201, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB3, Length 610 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3-201ENST00000248948 RLN2P04090 185 aa9.35□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 OR5G3P0C626 314 aa9.35□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 C4BPBP20851 252 aa9.35□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 H2BFSP57053 126 aa9.35□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.35□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.35□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 ARL6Q9H0F7 186 aa9.35□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 ARV1Q9H2C2 271 aa9.35□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 A0A087X0K7 114 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 A0A0J9YWU9 116 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 MPDU1O75352 247 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 SIX6O95475 246 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 CAMLGP49069 296 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 BAXQ07812 192 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 ATP6V1FQ16864 119 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 UHRF2Q96PU4 802 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
VPREB3-201ENST00000248948 TENM2Q9NT68 2774 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 H3BMM0 161 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 COX7A2P2O60397 106 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 CXCL2P19875 107 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 PRR20EP86478 221 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 PRR20CP86479 221 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 PRR20DP86480 221 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 PRR20BP86481 221 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 PRR20AP86496 221 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 C16orf92Q96LL3 132 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 RARRES2Q99969 163 aa9.33□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 RYR3Q15413 4870 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 OPCMLQ14982 345 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 PATE2Q6UY27 113 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 Q6ZRG5 221 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 OR11H2Q8NH07 326 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 C17orf77Q96MU5 243 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 LINC00052Q96N35 136 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 PFDN5Q99471 154 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 RSG1Q9BU20 258 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 RPRMQ9NS64 109 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.32□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 H0YIZ8 118 aa9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 MPC2O95563 127 aa9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 FGF7P21781 194 aa9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 LYSTQ99698 3801 aa9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 ALG5Q9Y673 324 aa9.31□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 A0A0J9YX75 114 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 A8MTW9 85 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 MIFP14174 115 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 B2MP61769 119 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 MIC13Q5XKP0 118 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 LCN15Q6UWW0 184 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.3□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.29□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 NUPR2A6NF83 97 aa9.29□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 NHLH2Q02577 135 aa9.29□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 Q8NAQ8 132 aa9.29□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 C20orf173Q96LM9 149 aa9.29□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.29□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.29□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 RYR2Q92736 4967 aa9.29□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 IGLC2P0DOY2 106 aa9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 CXCL3P19876 107 aa9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF709Q8N972 641 aa9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 ASB13Q8WXK3 278 aa9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 ATP5SQ99766 215 aa9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 MFFQ9GZY8 342 aa9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 MBD2Q9UBB5 411 aa9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 HSPB11Q9Y547 144 aa9.28□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.27□□□□□ -0.92
VPREB3-201ENST00000248948 CXorf65A6NEN9 183 aa9.27□□□□□ -0.93
VPREB3-201ENST00000248948 F6UB75 175 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms