RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615520.1

LHX9-208, Transcript of LIM homeobox 9, human

Gene LHX9, Length 1,051 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LHX9-208	ENST00000615520	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520		A0A0D9SG52	128 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	ZNF345	Q14585	488 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	HYLS1	Q96M11	299 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	NEURL2	Q9BR09	285 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	TAAR5	O14804	337 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	CXCL2	P19875	107 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	S100A7	P31151	101 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	GUCA2B	Q16661	112 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	UHRF2	Q96PU4	802 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	RNF2	Q99496	336 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	SLC25A22	Q9H936	323 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	PRR20E	P86478	221 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	PRR20C	P86479	221 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	PRR20D	P86480	221 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	PRR20B	P86481	221 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	PRR20A	P86496	221 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	TCF24	Q7RTU0	167 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	S100A7A	Q86SG5	101 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	ARV1	Q9H2C2	271 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	PLP1	P60201	277 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	LEMD1	Q68G75	181 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	TMUB2	Q71RG4	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	PFDN5	Q99471	154 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	VSIR	Q9H7M9	311 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	BCL2L11	O43521	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	JTB	O76095	146 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	TFPI2	P48307	235 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520		U3KQE9	123 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520		H3BRN7	92 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	WIPF1	O43516	503 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LHX9-208	ENST00000615520	HELT	A6NFD8	242 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	ZNF98	A6NK75	572 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	BUB3	O43684	328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	GP9	P14770	177 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	GLMP	Q8WWB7	406 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	PRR25	Q96S07	402 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.7	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	CD5	P06127	495 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	PAFAH1B2	P68402	229 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	FBN3	Q75N90	2809 aa		13.69	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.68	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
LHX9-208	ENST00000615520	FAM78B	Q5VT40	261 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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