RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A7P31151 101 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8N1Y9 231 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLMPQ8WWB7 406 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R14BQ96C90 147 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5SQ99766 215 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD81P60033 236 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL11P62913 178 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PXDC1Q5TGL8 231 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 STPG3Q8N7X2 389 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 AQP10Q96PS8 301 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 HELTA6NFD8 242 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4C46A6NHA9 309 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD7P09564 240 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAFAH1B2P68402 229 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEURL2Q9BR09 285 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 DOK5Q9P104 306 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 G3V3Q6 166 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 HYPMO75409 117 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB121Q5J5C9 76 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf194Q5T5A4 169 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL6Q9H0F7 186 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL29P47914 159 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 OPCMLQ14982 345 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPCDR1Q9BY65 106 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM3Q9BZL3 60 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR20EP86478 221 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR20CP86479 221 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR20DP86480 221 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR20BP86481 221 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR20AP86496 221 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIGD1AQ9Y241 93 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5G3P0C626 314 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIC13Q5XKP0 118 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A7AQ86SG5 101 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 GBGT1Q8N5D6 347 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 MS4A6AQ9H2W1 248 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZRG5 221 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL17Q9UF56 701 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFSF18Q9UNG2 199 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV2A0A0B4J234 112 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF98A6NK75 572 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARV1Q9H2C2 271 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 TFPI2P48307 235 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 B2MP61769 119 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BRN7 92 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNA5P01569 189 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PATE2Q6UY27 113 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8I2Q8N0Y5 310 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 STXBP6Q8NFX7 210 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC39A9Q9NUM3 307 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PXMP4Q9Y6I8 212 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF222A6NCQ9 220 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 UHRF2Q96PU4 802 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A22Q9H936 323 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX7A2P2O60397 106 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF709Q8N972 641 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 WFDC1Q9HC57 220 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNIP2Q9NS61 270 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf73Q9NVV2 129 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR11H12B2RN74 326 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMLR1H3BR10 107 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 WFDC3Q8IUB2 231 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCGB1C1Q8TD33 95 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM37Q8WXS4 190 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM110AQ9BQ89 295 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1L4Q8NGR5 311 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCRT1Q9BWW7 348 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRN1Q9NPD7 142 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF24Q9Y225 148 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 A8MZ25 164 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf112F2Z3M2 114 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF266Q14584 549 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCANP1Q8TF63 244 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR82Q96P67 336 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 PFDN5Q99471 154 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ODF3L2Q3SX64 289 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf113Q5VZT2 155 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 LEMD1Q68G75 181 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00305Q7Z4B0 112 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 WFDC10AQ9H1F0 79 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A32Q9H2D1 315 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7EQG2 157 aa24.68■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARPC5O15511 151 aa24.68■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB125Q8N687 156 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms