RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528149.5

CCDC90B-210, Transcript of coiled-coil domain containing 90B, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC90B, Length 987 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90B-210ENST00000528149 CBLN1P23435 193 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 CAMLGP49069 296 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 OPCMLQ14982 345 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 ST8SIA2Q92186 375 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 METTL26Q96S19 204 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 MFFQ9GZY8 342 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 MLXQ9UH92 298 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC90B-210ENST00000528149 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 K7EMT4 169 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 IFNA5P01569 189 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 C1QBP02746 253 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RAB31Q13636 194 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 STPG3Q8N7X2 389 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 ASCL2Q99929 193 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RSG1Q9BU20 258 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 SMPXQ9UHP9 88 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RABAC1Q9UI14 185 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 HMSDA8MTL9 139 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 CHEK1O14757 476 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 C8orf88P0DMB2 117 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 ORM2P19652 201 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 CXCL2P19875 107 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 NPPCP23582 126 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 CRYBB3P26998 211 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 SELENOTP62341 195 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 MARC2Q969Z3 335 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 NEURL2Q9BR09 285 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 ARL6Q9H0F7 186 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RFNGQ9Y644 331 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 MPDU1O75352 247 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 IGLV1-51P01701 117 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 OR5G3P0C626 314 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 INSL3P51460 131 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 B2MP61769 119 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 ZNF345Q14585 488 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 COX7A2P2O60397 106 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 PLP1P60201 277 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 PRR20EP86478 221 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 PRR20CP86479 221 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 PRR20DP86480 221 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 PRR20BP86481 221 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 PRR20AP86496 221 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 ZNF266Q14584 549 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 ZFP69Q49AA0 526 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 ZNF709Q8N972 641 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 UHRF2Q96PU4 802 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 RNF2Q99496 336 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 VSIRQ9H7M9 311 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 U3KQE9 123 aa8.68□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 H3BRN7 92 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 BCL2L11O43521 198 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 HYPMO75409 117 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 BMI1P35226 326 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 LEMD1Q68G75 181 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 PATE2Q6UY27 113 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 TMUB2Q71RG4 321 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 TCF24Q7RTU0 167 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 GLMPQ8WWB7 406 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC90B-210ENST00000528149 ARV1Q9H2C2 271 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms