RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489617.5

CDK18-211, Transcript of cyclin dependent kinase 18, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CDK18, Length 3,190 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18-211ENST00000489617 TMEM42Q69YG0 159 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 A0A1W2PRE2 83 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 SYNGR3O43761 229 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 ARL16Q0P5N6 197 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 TM4SF20Q53R12 229 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 NMSQ5H8A3 153 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 TIMM23BQ5SRD1 257 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 C18orf15Q96N68 181 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.5□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 H3BMG7 143 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 COX8AP10176 69 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 CR1LQ2VPA4 569 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 SSX8Q7RTT4 187 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 TEX29Q8N6K0 151 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 C3orf56Q8N813 242 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 USF3Q68DE3 2245 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 MT-ND6P03923 174 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 ZNF32P17041 273 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 GLRXP35754 106 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 FHL3Q13643 280 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 Q6AWC8 147 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 NRGNQ92686 78 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 INSIG2Q9Y5U4 225 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 APCSP02743 223 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 SCTP09683 121 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 CT45A10P0DMU9 189 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 B4GALT1P15291 398 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 ZNF146Q15072 292 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 CCL28Q9NRJ3 127 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa9.49□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 IGHV3-7P01780 117 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 CDSNQ15517 529 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 VWC2Q2TAL6 325 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 HSPB6O14558 160 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 FOXH1O75593 365 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 GNLYP22749 145 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 ZNF525Q8N782 197 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.48□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 K7EN84 100 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 WIPF1O43516 503 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 KIR2DS4P43632 304 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 KLRD1Q13241 179 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 A0A1W2PRD5 423 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 A0A1W2PRF3 423 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 A0A1W2PRM7 423 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 LYZL6O75951 148 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 APOMO95445 188 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 KLRB1Q12918 225 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 ITPR2Q14571 2701 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 CHEK1O14757 476 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 IAPPP10997 89 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 MFAP4P55083 255 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 AMTNQ6UX39 209 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 OR4C12Q96R67 309 aa9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 hADV38S2A0JD32 116 aa9.46□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 REG1BP48304 166 aa9.46□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 OR51H1Q8NH63 302 aa9.46□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 KIR2DL4Q99706 377 aa9.46□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.46□□□□□ -0.89
CDK18-211ENST00000489617 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.46□□□□□ -0.9
CDK18-211ENST00000489617 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa9.46□□□□□ -0.9
CDK18-211ENST00000489617 A0A1B0GWB2 263 aa9.46□□□□□ -0.9
CDK18-211ENST00000489617 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
CDK18-211ENST00000489617 KIR2DS1Q14954 304 aa9.46□□□□□ -0.9
CDK18-211ENST00000489617 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CDK18-211ENST00000489617 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.46□□□□□ -0.9
CDK18-211ENST00000489617 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.46□□□□□ -0.9
CDK18-211ENST00000489617 OR4A16Q8NH70 328 aa9.46□□□□□ -0.9
CDK18-211ENST00000489617 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.46□□□□□ -0.9
CDK18-211ENST00000489617 K7ERJ3 54 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms