RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 METTL26Q96S19 204 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SRRQ9GZT4 340 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 U3KQE9 123 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 LCE6AA0A183 80 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-48P01763 117 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 AKR1C4P17516 323 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 NPPCP23582 126 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TCF24Q7RTU0 167 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-218ENST00000629219 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 MED6O75586 246 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 SFT2D2O95562 160 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 TOMM40O96008 361 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 OR10J1P30954 320 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 STPG3Q8N7X2 389 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 DTD1Q8TEA8 209 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 Q8WTZ3 238 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 ST8SIA2Q92186 375 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 RNF183Q96D59 192 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 HELTA6NFD8 242 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 SPRY2O43597 315 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 NDUFB6O95139 128 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 P2RY1P47900 373 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 RND2P52198 227 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 RBKSQ9H477 322 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 RETNQ9HD89 108 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 K7EQG2 157 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 IFNA10P01566 189 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 FABP1P07148 127 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 VAMP1P23763 118 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 RAB11AP62491 216 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 PPP1R1AQ13522 171 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 MLANAQ16655 118 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 TIGITQ495A1 244 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 TRIQKQ629K1 86 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 OR1S1Q8NH92 325 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 DCANP1Q8TF63 244 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 CSTL1Q9H114 145 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 CENPXA8MT69 81 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 MPTX1A8MV57 137 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 NXPH3O95157 252 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 IFNA4P05014 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 RD3LP0DJH9 198 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 INPP1P49441 399 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 BAK1Q16611 211 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 LILRB2Q8N423 598 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 THAP8Q8NA92 274 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 GLMPQ8WWB7 406 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 NPIPB3Q92617 1050 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 SLC35E1Q96K37 410 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 PRR13Q9NZ81 148 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 C9orf170A2RU37 121 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-218ENST00000629219 BUB3O43684 328 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.2 ms