RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 AKR1C4P17516 323 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 NPPCP23582 126 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 CRYBB3P26998 211 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 NPBWR1P48145 328 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM187Q14656 261 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 GPR141Q7Z602 305 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 OR4X1Q8NH49 305 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 AP3S1Q92572 193 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 NPIPB3Q92617 1050 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 GINS3Q9BRX5 216 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 RBKSQ9H477 322 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 X6R8D5 127 aa6.46□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 IGKV3-20P01619 116 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 AKAIN1P0CW23 69 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 TNFSF8P32971 234 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 SPCS3P61009 180 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF90Q03938 601 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 PSMG4Q5JS54 123 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 STHQ8IWL8 128 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 GLMPQ8WWB7 406 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 ENY2Q9NPA8 101 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 MCUBQ9NWR8 336 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 U3KQE9 123 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 IGLL5B9A064 214 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 H3BMQ9 156 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 IL4P05112 153 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 IAPPP10997 89 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 PSG1P11464 419 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 TBPP20226 339 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 OR10J1P30954 320 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 PAFAH1B2P68402 229 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 DHRS2Q13268 280 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 OR2F1Q13607 317 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 AARDQ4LEZ3 155 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 C2orf83Q53S99 150 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 Q6ZTC4 211 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 METTL26Q96S19 204 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 RAB40CQ96S21 281 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 DISC1C4P0D8 188 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 F6UB75 175 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 PRM2P04554 102 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 NPY1RP25929 384 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 HLA-DMBP28068 263 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 HTR2BP41595 481 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 NMSQ5H8A3 153 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 XP32Q5T750 250 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 SOSTQ9BQB4 213 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 XCL2Q9UBD3 114 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 APLNQ9ULZ1 77 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 HELTA6NFD8 242 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 CORTO00230 105 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 CTDSPLO15194 276 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 IFNA10P01566 189 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF79Q15937 498 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 OR52E5Q8NH55 327 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 Q8WTZ3 238 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 TRIM63Q969Q1 353 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 C17orf77Q96MU5 243 aa6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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