RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 NAA60Q9H7X0 242 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 B3GALNT1O75752 331 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 CDS2O95674 445 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 CD74P04233 296 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 IL4P05112 153 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 P0C879 139 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SPP1P10451 314 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 AKR1C4P17516 323 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 HLA-DMBP28068 263 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 NOXA1Q86UR1 476 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 NPIPB3Q92617 1050 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB40CQ96S21 281 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 MCUBQ9NWR8 336 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 PRR13Q9NZ81 148 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 XCL2Q9UBD3 114 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 RYR1P21817 5038 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 C11orf94C9JXX5 98 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV1-17P01599 117 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV3-20P01619 116 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 RD3LP0DJH9 198 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A4P12235 298 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 MIFP14174 115 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 NPY1RP25929 384 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 C2orf83Q53S99 150 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 OR52E5Q8NH55 327 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00052Q96N35 136 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 ZFP92A6NM28 416 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLC1P0CG04 106 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 C4BPBP20851 252 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 EMP1P54849 157 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 TCTAP57738 103 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 FXYD7P58549 80 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SPCS2Q15005 226 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 Q6ZTC4 211 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 LGI3Q8N145 548 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 Q8NAQ8 132 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 OR1S1Q8NH92 325 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 DCANP1Q8TF63 244 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 PRRT1Q99946 306 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 RBKSQ9H477 322 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 GPR132Q9UNW8 380 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP1-204ENST00000459646 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM18P0DKX4 95 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PSG1P11464 419 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 ANXA3P12429 323 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 ID1P41134 155 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PRR20EP86478 221 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PRR20CP86479 221 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PRR20DP86480 221 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PRR20BP86481 221 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PRR20AP86496 221 aa6.21□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 OR2F1Q13607 317 aa6.21□□□□□ -1.42
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