RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 MCFD2Q8NI22 146 aa8.45□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 DCANP1Q8TF63 244 aa8.45□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.45□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 FAM25AB3EWG3 89 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 FAM25CB3EWG5 89 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 FAM25GB3EWG6 89 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 ATG12O94817 140 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV1-17P01599 117 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 CD3DP04234 171 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 DHRS2Q13268 280 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 COPZ2Q9P299 210 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 KLK11Q9UBX7 282 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 PKD1P98161 4303 aa8.44□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 HELTA6NFD8 242 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 RND2P52198 227 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 OR52I2Q8NH67 350 aa8.43□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 CTDSP2O14595 271 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 RGS5O15539 181 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 AMBPP02760 352 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 IGLC1P0CG04 106 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 UCP1P25874 307 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 BSXQ3C1V8 233 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZRM9 215 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 GLMPQ8WWB7 406 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 RNF126Q9BV68 326 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 XCL2Q9UBD3 114 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.42□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 NXPH3O95157 252 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 IL4P05112 153 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 OR5AC1P0C628 307 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 OR10J1P30954 320 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 HTR2BP41595 481 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 SPCS3P61009 180 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 DHODHQ02127 395 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 C12orf74Q32Q52 190 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.41□□□□□ -1.06
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GARNL3-210ENST00000453030 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.41□□□□□ -1.06
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GARNL3-210ENST00000453030 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 Q8WTZ3 238 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 AP3S1Q92572 193 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 RAB40CQ96S21 281 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 CACNG5Q9UF02 275 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 U3KQE9 123 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 NACAE9PAV3 2078 aa8.41□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 M0R2N4 97 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 TBPP20226 339 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 MZT2AQ6P582 158 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 ACY3Q96HD9 319 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.4□□□□□ -1.06
GARNL3-210ENST00000453030 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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GARNL3-210ENST00000453030 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 RAB3DO95716 219 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 SLC25A4P12235 298 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 S100A5P33763 92 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 TAS2R19P59542 299 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 FAM219AQ8IW50 185 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 TERB2Q8NHR7 220 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 NAA60Q9H7X0 242 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 NRN1Q9NPD7 142 aa8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GARNL3-210ENST00000453030 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.38□□□□□ -1.07
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