RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 NPCDR1Q9BY65 106 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 NWD1Q149M9 1564 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SPINK9Q5DT21 86 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 MIC13Q5XKP0 118 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DSCR8Q96T75 97 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 RBAKDNA6NC62 111 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 FAM90A10PA6NDY2 464 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM90A24PP0C7X0 464 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 HLA-DMBP28068 263 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 MPV17P39210 176 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PPV9 198 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 SCN5AQ14524 2016 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 IMUPQ9GZP8 106 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 LAMB4A4D0S4 1761 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TAF1P21675 1872 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PEX7O00628 323 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PLNP26678 52 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C1QL2Q7Z5L3 287 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SHROOM3Q8TF72 1996 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 MED12Q93074 2177 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0D9SEW6 157 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TCRAP04437 139 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 GATA4P43694 442 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DCAF4L2Q8NA75 395 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 INSL3P51460 131 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 CRYGBP07316 175 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ELANEP08246 267 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SRD5A1P18405 259 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF138P52744 262 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 HIGD1BQ9P298 99 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRB1O14514 1584 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DUOX1Q9NRD9 1551 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DYSFO75923 2080 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 AMELYQ99218 206 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A15Q9Y619 301 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 CD163L1Q9NR16 1453 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A0B4J2C4 111 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-209ENST00000442510 NPIPB3Q92617 1050 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SCAMP4Q969E2 229 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 CARD19Q96LW7 228 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS46E5RG02 174 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 BRI3O95415 125 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 CGAP01215 116 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 CD164Q04900 197 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZVL8 140 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 WFDC6Q9BQY6 131 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 CALYQ9NYX4 217 aa4.61□□□□□ -1.67
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