RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 A0A1W2PS18 150 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 MPTX1A8MV57 137 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 CDS2O95674 445 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM50AO95807 157 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 OR5AC1P0C628 307 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 AKAIN1P0CW23 69 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 SPCS3P61009 180 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 DHODHQ02127 395 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 IL18Q14116 193 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 VSIRQ9H7M9 311 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 NAA60Q9H7X0 242 aa14.93□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 CTDSP2O14595 271 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 CLN5O75503 358 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 NPPCP23582 126 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 HTR2BP41595 481 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 OR4X1Q8NH49 305 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 OR52E5Q8NH55 327 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 ST8SIA2Q92186 375 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 METTL26Q96S19 204 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 PRRT1Q99946 306 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 CACFD1Q9UGQ2 172 aa14.92□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 CTDSPLO15194 276 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 DFFBO76075 338 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM230Q96A57 120 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 ZFAND3Q9H8U3 227 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 A0A0G2JRQ6 117 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 SPCS2Q15005 226 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 MS4A6AQ9H2W1 248 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC9B-201ENST00000311308 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 BSXQ3C1V8 233 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 AARDQ4LEZ3 155 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 CACNG5Q9UF02 275 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 GPR132Q9UNW8 380 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 A0A1B0GU03 582 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF124Q15973 351 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 Q6ZRM9 215 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 NOXA1Q86UR1 476 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 RARRES2Q99969 163 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 RABAC1Q9UI14 185 aa14.88□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 SLC25A4P12235 298 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 TMBIM6P55061 237 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 DEFB131AP59861 70 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 C2orf83Q53S99 150 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 STHQ8IWL8 128 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 LILRB2Q8N423 598 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 OR1S2Q8NGQ3 325 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 GPR146Q96CH1 333 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.86□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 LY6G6CO95867 125 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 CRYBB3P26998 211 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 P2RY1P47900 373 aa14.85□□□□□ -0.03
TTC9B-201ENST00000311308 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms