RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	RDH5	Q92781	318 aa		12.66	□□□□□ -0.38
BBS1-225	ENST00000630659	HSPB6	O14558	160 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BBS1-225	ENST00000630659	MPDU1	O75352	247 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BBS1-225	ENST00000630659	IER3	P46695	156 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BBS1-225	ENST00000630659	MZT1	Q08AG7	82 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BBS1-225	ENST00000630659	MSMP	Q1L6U9	139 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BBS1-225	ENST00000630659	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BBS1-225	ENST00000630659	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BBS1-225	ENST00000630659	UHRF2	Q96PU4	802 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BBS1-225	ENST00000630659	DUSP13	Q9UII6	198 aa		12.65	□□□□□ -0.38
BBS1-225	ENST00000630659	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PPV4	95 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	SH2D1B	O14796	132 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	IGHV3-13	P01766	116 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ATP5G3	P48201	142 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	NIT1	Q86X76	327 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	RND1	Q92730	232 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	GPHA2	Q96T91	129 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659		M0QZ24	198 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	CD40	P25942	277 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF146	Q15072	292 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TCF24	Q7RTU0	167 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	MMD2	Q8IY49	270 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF114	Q8NC26	417 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	C11orf52	Q96A22	123 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	HES4	Q9HCC6	221 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ATM	Q13315	3056 aa		12.64	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	OR2H2	O95918	312 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	CXorf1	O96002	111 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	MT-CO2	P00403	227 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	CA2	P00918	260 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	PMCH	P20382	165 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	THBS3	P49746	956 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	CX3CL1	P78423	397 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	RNF114	Q9Y508	228 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	BSN	Q9UPA5	3926 aa		12.63	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00869	P0C866	280 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	SELENOV	P59797	346 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TLE1	Q04724	770 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	VHLL	Q6RSH7	139 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	RASL11A	Q6T310	242 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	SSX8	Q7RTT4	187 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	OCC1	Q8TAD7	63 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	DERL1	Q9BUN8	251 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ST20	Q9HBF5	79 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659		F2Z2F3	143 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659		H0YJW9	148 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	WDR82	Q6UXN9	313 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	AMY1A	P04745	511 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	OR4A47	Q6IF82	309 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB125	Q8N687	156 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		12.61	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	WNT9B	O14905	357 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	HAND1	O96004	215 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TFF3	Q07654	80 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF585B	Q52M93	769 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TNFRSF14	Q92956	283 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	C1RL	Q9NZP8	487 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	THBD	P07204	575 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	STAG3L2	P0CL84	134 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	STAG3L3	P0CL85	134 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	FGFRL1	Q8N441	504 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	NUP37	Q8NFH4	326 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF596	Q8TC21	504 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659	TSKU	Q8WUA8	353 aa		12.6	□□□□□ -0.39
BBS1-225	ENST00000630659		V9GYV3	84 aa		12.6	□□□□□ -0.39

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms