RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM56Q96MV1 263 aa10.02□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MS4A10Q96PG2 267 aa10.02□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa10.02□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NSG2Q9Y328 171 aa10.02□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR51B2Q9Y5P1 312 aa10.02□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa10.02□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A0G2JLM5 398 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLA2G10O15496 165 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LYRM1O43325 122 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DHFRP00374 187 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PF4P02776 101 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CRYGCP07315 174 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAPPC2P0DI81 140 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAPPC2BP0DI82 140 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PSMB6P28072 239 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM187Q14656 261 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM268Q5VZI3 342 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ETV3LQ6ZN32 361 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF429Q86V71 674 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LHFPL5Q8TAF8 219 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GNB4Q9HAV0 340 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa10.01□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DBX1A6NMT0 343 aa10□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 I3L521 148 aa10□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AREGP15514 252 aa10□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CTRB1P17538 263 aa10□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYCNOSP40205 109 aa10□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CTRB2Q6GPI1 263 aa10□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAX2Q96IS3 184 aa10□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 USMG5Q96IX5 58 aa10□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A0B4J293 547 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM223BA6NKX1 122 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCL24O00175 119 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UPK1BO75841 260 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VAMP1P23763 118 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRCDQ00LT1 54 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WT1-ASQ06250 92 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ASAH1Q13510 395 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPP1R1AQ13522 171 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FHL3Q13643 280 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLK9Q2XQG4 91 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEFB136Q30KP8 78 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LGI3Q8N145 548 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC35G3Q8N808 338 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NECAP1Q8NC96 275 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 P2RX4Q99571 388 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HINT2Q9BX68 163 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.99□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A0B4J2A0 478 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A0G2JRQ6 117 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SFT2D2O95562 160 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGHV3-11P01762 117 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRH1P02810 166 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 REG1AP05451 166 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEFA4P12838 97 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RHOGP84095 191 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AARDQ4LEZ3 155 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LRTM2Q8N967 370 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR11H1Q8NG94 326 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR5B12Q96R08 314 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRR13Q9NZ81 148 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.98□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYB5BO43169 146 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ST8SIA3O43173 380 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR8U8P0C7N1 319 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR13C7P0DN81 318 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CD33P20138 364 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAB25P57735 213 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF616Q08AN1 781 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DUX3Q96PT4 197 aa9.97□□□□□ -0.81
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms