RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 TFF3Q07654 80 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 IGFBP7Q16270 282 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CDNFQ49AH0 187 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MUC21Q5SSG8 566 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 LCE1EQ5T753 118 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TRIQKQ629K1 86 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SSX8Q7RTT4 187 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FTMTQ8N4E7 242 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ACBD4Q8NC06 268 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OR8G5Q8NG78 346 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf52Q96A22 123 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MUCL1Q96DR8 90 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PRAC1Q96KF2 57 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 GPER1Q99527 375 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SLC22A4Q9H015 551 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CST11Q9H112 138 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 METTL9Q9H1A3 318 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CACNG2Q9Y698 323 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PKDREJQ9NTG1 2253 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 DSCAMO60469 2012 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 VPS13CQ709C8 3753 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FUOMA2VDF0 154 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM235A6NFC5 223 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 F6UB75 175 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 M0R1B8 84 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SYNGR1O43759 233 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 NXPH4O95158 308 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CD74P04233 296 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ARG1P05089 322 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 GTF2F2P13984 249 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 GNB3P16520 340 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CHRNB4P30926 498 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PMELP40967 661 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FGF12P61328 243 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 GNG3P63215 75 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 WDR82Q6UXN9 313 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 Q6ZN92 141 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.22□□□□□ -1.89
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PTPRC-214ENST00000530727 NUP37Q8NFH4 326 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ARPC1AQ92747 370 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PTH2Q96A98 100 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 LITAFQ99732 161 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PECRQ9BY49 303 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 RHOFQ9HBH0 211 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 HES4Q9HCC6 221 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM100Q9NV29 134 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 DYSFO75923 2080 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 J3QT63 122 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 K7EQD1 137 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FGF16O43320 207 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TGOLN2O43493 480 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 CD3DP04234 171 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PGA5P0DJD9 388 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 FABP6P51161 128 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 RSU1Q15404 277 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF726P1Q15940 193 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TAF9Q16594 264 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PIGYQ3MUY2 71 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.21□□□□□ -1.89
PTPRC-214ENST00000530727 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.21□□□□□ -1.89
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