RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A0G2JRQ6	117 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	C15orf61	A6NNL5	157 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	IGKV1-5	P01602	117 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	IGLV1-51	P01701	117 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	GP9	P14770	177 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	ERVK-16	P61578	105 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	RND3	P61587	244 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	SP6	Q3SY56	376 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	TERB2	Q8NHR7	220 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	MCFD2	Q8NI22	146 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	B9D2	Q9BPU9	175 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	HINT2	Q9BX68	163 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC160	A6NGH7	325 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555		H0Y980	276 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	OR2C1	O95371	312 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	SERPINE2	P07093	398 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	FGF2	P09038	288 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555		P0C879	139 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	OR13C7	P0DN81	318 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	DEFA4	P12838	97 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	TBP	P20226	339 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF79	Q15937	498 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	SPINK9	Q5DT21	86 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	OR4C12	Q96R67	309 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	ASCL2	Q99929	193 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555		V9GYH0	126 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	FABP12	A6NFH5	140 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555		F8W735	103 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	AKAIN1	P0CW23	69 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	ARL3	P36405	182 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	CD69	Q07108	199 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	CADM3	Q8N126	398 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555		Q8N1Y9	231 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	TRIM63	Q969Q1	353 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM230	Q96A57	120 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	PRR13	Q9NZ81	148 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A0B4J293	547 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555		K7EIM0	57 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	SNAPC5	O75971	98 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	CLEC3B	P05452	202 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	OR5AC1	P0C628	307 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	UCP1	P25874	307 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	S100G	P29377	79 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	GPR183	P32249	361 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	MEF2D	Q14814	521 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555		Q6ZRM9	215 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	COPZ2	Q9P299	210 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	PRND	Q9UKY0	176 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	GPR132	Q9UNW8	380 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM213	A2RRL7	107 aa		7.2	□□□□□ -1.26

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