RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	CTRB1	P17538	263 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSMB6	P28072	239 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF616	Q08AN1	781 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	SP6	Q3SY56	376 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRND	Q9UKY0	176 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM223B	A6NKX1	122 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV1-5	P01602	117 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRH1	P02810	166 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5B3	Q8NH48	314 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A087WW49	117 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR8U8	P0C7N1	319 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	RHOG	P84095	191 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	NECAP1	Q8NC96	275 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC01619	G3V211	115 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATG12	O94817	140 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	IL7	P13232	177 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	DEFA5	Q01523	94 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	DHODH	Q02127	395 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	WT1-AS	Q06250	92 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRIQK	Q629K1	86 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0B4J293	547 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	DHFR	P00374	187 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	DPF1	Q92782	380 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0G2JRQ6	117 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2J3	O76001	311 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	REG1A	P05451	166 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	AKR1C2	P52895	323 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATP5G2	Q06055	141 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM187	Q14656	261 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4A16	Q8NH70	328 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	DCUN1D4	Q92564	292 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	INPP1	P49441	399 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLURP1	P55000	103 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB25	P57735	213 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	C15orf32	Q32M92	178 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-223	ENST00000512131	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		13.27	□□□□□ -0.29

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