RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 G3V4G9 280 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 PLA2G10O15496 165 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SNAPC5O75971 98 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 BRI3O95415 125 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CDS2O95674 445 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CRYGCP07315 174 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 FGF2P09038 288 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 AKR1C4P17516 323 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CTRB1P17538 263 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 PSMB6P28072 239 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 BTCP35070 178 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 AKR1C2P52895 323 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RUNX1Q01196 453 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 C1QL4Q86Z23 238 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 PRNDQ9UKY0 176 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 A0A087WW49 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 B3GALNT1O75752 331 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR2J3O76001 311 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IGLL1P15814 213 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RAB25P57735 213 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RHOGP84095 191 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 DHODHQ02127 395 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 WT1-ASQ06250 92 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ZNF616Q08AN1 781 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 FHL3Q13643 280 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TMEM187Q14656 261 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 Q6ZRM9 215 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR4A16Q8NH70 328 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 S100ZQ8WXG8 99 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 GALNT14Q96FL9 552 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TSC22D3Q99576 134 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 HINT2Q9BX68 163 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 A0A0B4J293 547 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 A0A0G2JLM5 398 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 NDUFB6O95139 128 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 NDUFB8O95169 186 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TRBV12-3P01733 135 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR13C7P0DN81 318 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SLURP1P55000 103 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SPINK9Q5DT21 86 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SLC35G3Q8N808 338 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR5B3Q8NH48 314 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 GPR146Q96CH1 333 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 USMG5Q96IX5 58 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TMEM56Q96MV1 263 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CCDC32Q9BV29 185 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 S4R3C0 116 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TNCP24821 2201 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 FAM223BA6NKX1 122 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CENPXA8MT69 81 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 LINC01619G3V211 115 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ST8SIA3O43173 380 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 LYRM1O43325 122 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 ATG12O94817 140 aa6.66□□□□□ -1.34
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