RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	FAM219A	Q8IW50	185 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	IL22RA2	Q969J5	263 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887		A0A0G2JLM5	398 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	CCL24	O00175	119 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	LYRM1	O43325	122 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	AKR1C4	P17516	323 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	PSMB6	P28072	239 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	SRPX	P78539	464 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	WT1-AS	Q06250	92 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF846	Q147U1	533 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	AARD	Q4LEZ3	155 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF429	Q86V71	674 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	OR4A16	Q8NH70	328 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	USMG5	Q96IX5	58 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	DUX3	Q96PT4	197 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	FBN3	Q75N90	2809 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887	PLXNB1	O43157	2135 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SFI1-222	ENST00000478887		A0A0B4J293	547 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	DHFR	P00374	187 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	IGHV3-11	P01762	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PRH1	P02810	166 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	REG1A	P05451	166 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ANXA3	P12429	323 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	RHOG	P84095	191 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PRCD	Q00LT1	54 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	DEFA5	Q01523	94 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF616	Q08AN1	781 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PPP1R1A	Q13522	171 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SLC35G3	Q8N808	338 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	NECAP1	Q8NC96	275 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR11H1	Q8NG94	326 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR5B12	Q96R08	314 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	VWF	P04275	2813 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887		A0A0B4J2A0	478 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	ST8SIA3	O43173	380 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	UPK1B	O75841	260 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SFT2D2	O95562	160 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR8U8	P0C7N1	319 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR13C7	P0DN81	318 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	CD33	P20138	364 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	VAMP1	P23763	118 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	NMS	Q5H8A3	153 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887		Q6ZRM9	215 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	LGI3	Q8N145	548 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	LRTM2	Q8N967	370 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	HINT2	Q9BX68	163 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	PRR13	Q9NZ81	148 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	TNC	P24821	2201 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887		A0A087WW49	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SFI1-222	ENST00000478887	LINC01619	G3V211	115 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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