RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC32Q9BV29 185 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 GNB4Q9HAV0 340 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 C15orf61A6NNL5 157 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CRYGCP07315 174 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8U8P0C7N1 319 aa11.94□□□□□ -0.5
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PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF616Q08AN1 781 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM209BQ5JX69 171 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 ETV3LQ6ZN32 361 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 NECAP1Q8NC96 275 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 OR11H1Q8NG94 326 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 GLYATL2Q8WU03 294 aa11.94□□□□□ -0.5
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PGGT1B-202ENST00000379615 IL22RA2Q969J5 263 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 HINT2Q9BX68 163 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM14BQ9NUH8 114 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 NSG2Q9Y328 171 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 E7EUB6 86 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-11P01762 117 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 MYOD1P15172 320 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 AREGP15514 252 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB25P57735 213 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 RHOGP84095 191 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5G2Q06055 141 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB136Q30KP8 78 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 THYN1Q9P016 225 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GW64 132 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLC7A0M8Q6 106 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01619G3V211 115 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV1-5P01602 117 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 OR13C7P0DN81 318 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CTRB1P17538 263 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 MECP2P51608 486 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 FHL3Q13643 280 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM268Q5VZI3 342 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CTRB2Q6GPI1 263 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF429Q86V71 674 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 OR1L6Q8NGR2 347 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM230Q96A57 120 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 DUX3Q96PT4 197 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CGB1A6NKQ9 187 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFB6O95139 128 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 PRH1P02810 166 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 ZP3P21754 424 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM187Q14656 261 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF846Q147U1 533 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 LGI3Q8N145 548 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2J3O76001 311 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 IFNA17P01571 189 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 P0C879 139 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 VAMP1P23763 118 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CCR6P51684 374 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 PRCDQ00LT1 54 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 KLK9Q2XQG4 91 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 C15orf32Q32M92 178 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHA3Q9HB20 300 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 KLK9Q9UKQ9 250 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0B4J293 547 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0B4J2A0 478 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 LYRM1O43325 122 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 REG1AP05451 166 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35G3Q8N808 338 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 CXorf58Q96LI9 332 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ENY2Q9NPA8 101 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.88□□□□□ -0.51
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