RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 H0YL77 283 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 H3BQ15 152 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ANGPTL7O43827 346 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF253O75346 499 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR2J2O76002 312 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NAPSAO96009 420 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PRH1P02810 166 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ARG1P05089 322 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TCN2P20062 427 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FUT3P21217 361 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 VDAC1P21796 283 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OPRM1P35372 400 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NPBWR2P48146 333 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RBP2P50120 134 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TAS2R30P59541 319 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CCL7P80098 99 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SHHQ15465 462 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TAF9Q16594 264 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MPV17LQ2QL34 196 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PIGYQ3MUY2 71 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TSPO2Q5TGU0 170 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZVQ6 151 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 LINC00596Q86U02 117 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR1F12Q8NHA8 337 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 M1APQ8TC57 530 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 Q8WTZ3 238 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RLN3Q8WXF3 142 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MR1Q95460 341 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM45BQ96B21 275 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SGK3Q96BR1 496 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TVP23CQ96ET8 276 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 BORCS8Q96FH0 119 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 AGMATQ9BSE5 352 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 WDR54Q9H977 334 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PROK2Q9HC23 129 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.26□□□□□ -1.89
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SGCE-211ENST00000522045 DOK5Q9P104 306 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SLC22A20A6NK97 555 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR5H1A6NKK0 313 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GJE1A6NN92 205 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MKRN2OSH3BPM6 223 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DEGS1O15121 323 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ADAM20O43506 726 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SSSCA1O60232 199 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2BKO60814 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SCRG1O75711 98 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 TMEM50AO95807 157 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 NRASP01111 189 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OPN1MWP04001 364 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2BJP06899 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CXCL1P09341 107 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CTXN2P0C2S0 81 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 OR13C7P0DN81 318 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 BCL2P10415 239 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 COX5BP10606 129 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 ZNF32P17041 273 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2BOP23527 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 S100A2P29034 98 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 GNRHRP30968 328 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 SRD5A2P31213 254 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2BBP33778 126 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 CEACAM6P40199 344 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-211ENST00000522045 KIR2DS4P43632 304 aa3.25□□□□□ -1.89
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