RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GTL3 188 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 MYF5P13349 255 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 SPINT3P49223 89 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GWA3 101 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM72BQ86X60 149 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 MS4A18Q3C1V0 323 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 IGHG4P01861 327 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 NUP35Q8NFH5 326 aa4.74□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 MRC1P22897 1456 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 GCHFRP30047 84 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PLGLAQ15195 96 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM196Q5HYL7 178 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM240Q5SV17 173 aa4.73□□□□□ -1.65
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