RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA8MH3BSY2 632 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BT86 120 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 COCHO43405 550 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSNA1O43805 119 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCL5P13501 91 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL28P46779 137 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB14P61106 215 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED21Q13503 144 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q1T7F1 81 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC36A2Q495M3 483 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDPK2PQ6A1A2 396 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 C5orf46Q6UWT4 87 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa0.63□□□□□ -2.31
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RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM9CQ8IZT9 166 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYNAPQ8N1N2 210 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGMS2Q8NHU3 365 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHST6Q9GZX3 395 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 CST9LQ9H4G1 147 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR84Q9NQS5 396 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 AK3Q9UIJ7 227 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 DKKL1Q9UK85 242 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRELID1Q9Y255 219 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF15Q9NS87 1388 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
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RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa0.62□□□□□ -2.31
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RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa0.62□□□□□ -2.31
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RNU6-552P-201ENST00000362869 DISC1C4P0D8 188 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLA2G10O15496 165 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRPP02741 224 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFPTP0C1Z6 253 aa0.62□□□□□ -2.31
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RNU6-552P-201ENST00000362869 CD151P48509 253 aa0.62□□□□□ -2.31
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RNU6-552P-201ENST00000362869 AQP4P55087 323 aa0.62□□□□□ -2.31
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RNU6-552P-201ENST00000362869 MOGQ16653 247 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf194Q5T5A4 169 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9orf64Q5T6V5 341 aa0.62□□□□□ -2.31
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RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa0.61□□□□□ -2.31
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RNU6-552P-201ENST00000362869 HIST2H3AQ71DI3 136 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSX8Q7RTT4 187 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
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RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D19Q8N5T2 526 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR51I2Q9H344 312 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXorf21Q9HAI6 301 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAT8Q9UHE5 227 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 C15orf41Q9Y2V0 281 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 PXMP4Q9Y6I8 212 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOTCH1P46531 2555 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR90Q96KV7 1748 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 TENM3Q9P273 2699 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 FLT4P35916 1363 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCC11Q96J66 1382 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0A6YYH2 397 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEIS3P1A6NDR6 274 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-552P-201ENST00000362869 A6NJ64 397 aa0.6□□□□□ -2.31
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