RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 MMD2Q8IY49 270 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 PNKDQ8N490 385 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 A0A0G2JMM0 328 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PPB8 328 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PRS3 328 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SNURFLB1AK76 121 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 FCN1O00602 326 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 WDR1O75083 606 aa8.24□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 WDR86Q86TI4 376 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 OR52E5Q8NH55 327 aa8.24□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.23□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 C3orf79P0CE67 100 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 TSPOP30536 169 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ARG2P78540 354 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.23□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.23□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SLC17A3O00476 420 aa8.23□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 RHOGP84095 191 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 CATR1Q13166 79 aa8.23□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 HLA-BQ31612 363 aa8.23□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 F5P12259 2224 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 PCSK5Q92824 1860 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.23□□□□□ -1.09
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HCG18-242ENST00000602319 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ABHD3Q8WU67 409 aa8.21□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.21□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.21□□□□□ -1.1
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HCG18-242ENST00000602319 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
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