RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 MGAMO43451 1857 aa7.27□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 NAT1P18440 290 aa7.27□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 KLK2P20151 261 aa7.27□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 FAM27E3Q08E93 113 aa7.27□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 TEPPQ6URK8 271 aa7.27□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 ALG14Q96F25 216 aa7.27□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 RBKSQ9H477 322 aa7.27□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.27□□□□□ -1.24
PDPR-210ENST00000568530 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
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PDPR-210ENST00000568530 CD7P09564 240 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDPR-210ENST00000568530 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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PDPR-210ENST00000568530 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.27□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDPR-210ENST00000568530 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.26□□□□□ -1.25
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PDPR-210ENST00000568530 PEX7O00628 323 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 PDCD6O75340 191 aa7.26□□□□□ -1.25
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PDPR-210ENST00000568530 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 TBX21Q9UL17 535 aa7.26□□□□□ -1.25
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PDPR-210ENST00000568530 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 GATD1Q8NB37 220 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.26□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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PDPR-210ENST00000568530 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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PDPR-210ENST00000568530 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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PDPR-210ENST00000568530 JPT2Q9H910 190 aa7.25□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 A0A0U1RQV5 110 aa7.25□□□□□ -1.25
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PDPR-210ENST00000568530 DEFB130AP0DP74 79 aa7.25□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 HBBP68871 147 aa7.25□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.25□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 C1QAP02745 245 aa7.24□□□□□ -1.25
PDPR-210ENST00000568530 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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