RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-208ENST00000506437 YPEL2Q96QA6 119 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 BANF2Q9H503 90 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 A0A1W2PPR1 153 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 CLDN14O95500 239 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 SFT2D2O95562 160 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 NRASP01111 189 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 GRPP07492 148 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 CHRM2P08172 466 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 PET100P0DJ07 73 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 AK3Q9UIJ7 227 aa9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 ZFP92A6NM28 416 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 SPRY3O43610 288 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 TAS2R30P59541 319 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 PRDX4Q13162 271 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 ADIRFQ15847 76 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 BRICD5Q6PL45 260 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 GPR146Q96CH1 333 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 BTF3L4Q96K17 158 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 LY6HO94772 140 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 OPN1MWP04001 364 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 DUSP1P28562 367 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 MTCP1P56278 107 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 TAF9Q16594 264 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 SMIM12Q96EX1 92 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 ACY3Q96HD9 319 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 GNG13Q9P2W3 67 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 IGLV3-1P01715 115 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 OMGP23515 440 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 Q6ZR03 302 aa9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ITGA3-208ENST00000506437 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 SLC17A2O00624 439 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 DEDDO75618 318 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 RHBDL1O75783 438 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 P2RY1P47900 373 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 KISS1Q15726 138 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 SPATA45Q537H7 98 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 OR4A47Q6IF82 309 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 CRIP3Q6Q6R5 217 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 ATOH7Q8N100 152 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 LFNGQ8NES3 379 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 HYPMO75409 117 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 LGALS7P47929 136 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 RUNX1Q01196 453 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 HOGA1Q86XE5 327 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 OR2Z1Q8NG97 314 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 ZNF732B4DXR9 585 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 SH2D1BO14796 132 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 MLNRO43193 412 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 CEACAM3P40198 252 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 NPBWR2P48146 333 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 FAM201AQ5SY85 155 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 NRGNQ92686 78 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 DSCAMO60469 2012 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 E7EQL1 145 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 SYNGR1O43759 233 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 TMEM225BP0DP42 221 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 CCL1P22362 96 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 TNFSF4P23510 183 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-208ENST00000506437 CCL8P80075 99 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms