RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PS18 150 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 H3BMM0 161 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 TUSC2O75896 110 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 SPEF2Q9C093 1822 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 MYO3AQ8NEV4 1616 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 HBBP68871 147 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF488Q96MN9 340 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 DEPDC5O75140 1603 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 ABCA6Q8N139 1617 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 FAM236CP0DP71 79 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 TEN1Q86WV5 123 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 WFDC11Q8NEX6 87 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 NABP1Q96AH0 204 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-209ENST00000442510 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.75□□□□□ -1.65
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