RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	NAPB	Q9H115	298 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0G2JS52	829 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ERICH2	A1L162	156 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	YEATS4	O95619	227 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	LIFR	P42702	1097 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM29	Q14134	588 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	NID2	Q14112	1375 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	TERF1	P54274	439 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1W2PQ27	194 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1W2PQ64	194 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1W2PQD8	194 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	JAK2	O60674	1132 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	PHKA1	P46020	1223 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	SCARF1	Q14162	830 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	KDM4A	O75164	1064 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB43	O43298	467 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ZPR1	O75312	459 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	CHRND	Q07001	517 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ITPK1	Q13572	414 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF214	Q8ND24	703 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	XBP1	P17861	261 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	TDO2	P48775	406 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	HAND2	P61296	217 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	TYRO3	Q06418	890 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTLL3-222	ENST00000459758	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26

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