RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HRH3Q9Y5N1 445 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RFNGQ9Y644 331 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLPP3O14495 311 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FCARP24071 287 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADIPOQQ15848 244 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR2H1Q9GZK4 316 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 B4DSR2 109 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LYZL6O75951 148 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LEPP41159 167 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TBX15Q96SF7 602 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNX11Q9Y5W9 270 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TAS2R60P59551 318 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SH2D5Q6ZV89 423 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM89A2RUT3 159 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NDUFA4O00483 81 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRSS2P07478 247 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF688P0C7X2 276 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF90Q03938 601 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UNC119Q13432 240 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF585BQ52M93 769 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CTGFP29279 349 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NBL1P41271 181 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZS49 121 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MS4A10Q96PG2 267 aa3.9□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRPP02741 224 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPINT1O43278 529 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FBXO24O75426 580 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZVH6 145 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BLNKQ8WV28 456 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRK2Q5S007 2527 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 H3BMH7 237 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C14orf177Q52M58 125 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TEX45Q8NA69 505 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C12orf49Q9H741 205 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CD160O95971 181 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OR1D5P58170 312 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FOXF1Q12946 379 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZWC4 215 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GAB2Q9UQC2 676 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TAPBPO15533 448 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FGF16O43320 207 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TSPAN2O60636 221 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EFEMP2O95967 443 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF32P17041 273 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IFITM3Q01628 133 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLLU1Q5K131 121 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRR7Q8TB68 274 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM210BQ96KR6 192 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MFNGO00587 321 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGHA2P01877 340 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM251Q8N6I4 163 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GUCD1Q96NT3 240 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ASCL2Q99929 193 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNFSF12O43508 249 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MMDQ15546 238 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TM4SF20Q53R12 229 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.89□□□□□ -1.79
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms