RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	HLA-DRB3	P79483	266 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MS4A10	Q96PG2	267 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CST11	Q9H112	138 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	B9D1	Q9UPM9	204 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	VSIG4	Q9Y279	399 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ANOS1	P23352	680 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	UCP3	P55916	312 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MMD	Q15546	238 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	LRP11	Q86VZ4	500 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR31	Q8NA23	367 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ERGIC1	Q969X5	290 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	BET1L	Q9NYM9	111 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	FUT9	Q9Y231	359 aa		6.13	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	WIPF3	A6NGB9	483 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495		H0YL77	283 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CORT	O00230	105 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TOX4	O94842	621 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CYB5A	P00167	134 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	AKR1C4	P17516	323 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CFP	P27918	469 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL8	P80075	99 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PSG4	Q00888	419 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	SLA	Q13239	276 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PET117	Q6UWS5	81 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF479	Q96JC4	524 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	LRP12	Q9Y561	859 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR5B21	A6NL26	309 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PIN1P1	O15428	100 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	SPRY3	O43610	288 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	YPEL1	O60688	119 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	FAH	P16930	419 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS7	P47929	136 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	GUSBP1	Q15486	140 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	SDSL	Q96GA7	329 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	YPEL2	Q96QA6	119 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	AMELY	Q99218	206 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GU03	582 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	RAMP3	O60896	148 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYGC	P07315	174 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	MUC15	Q8N387	334 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF519	Q8TB69	540 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	AQP3	Q92482	292 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	DYRK2	Q92630	601 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL19	Q99731	98 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CMC2	Q9NRP2	79 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1456	Q9P272	454 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	CLN8	Q9UBY8	286 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXL17	Q9UF56	701 aa		6.12	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495		M0QYG6	137 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PRH1	P02810	166 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5J2	P56134	94 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM222B	Q8WU58	562 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	PELI1	Q96FA3	418 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf50	Q96LR7	162 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP6V0B	Q99437	205 aa		6.11	□□□□□ -1.43
LETMD1-238	ENST00000623495	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		6.11	□□□□□ -1.43

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