RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		6.89	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		6.89	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR2V2	Q96R30	315 aa		6.89	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		6.89	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PKIB	Q9C010	78 aa		6.89	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PRND	Q9UKY0	176 aa		6.89	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	CXorf1	O96002	111 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	HPRT1	P00492	218 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	FA2H	Q7L5A8	372 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	RNF144B	Q7Z419	303 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR4X1	Q8NH49	305 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	FGF11	Q92914	225 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	LEAP2	Q969E1	77 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	WNT9B	O14905	357 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	CCKAR	P32238	428 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	STPG1	Q5TH74	334 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	WDR73	Q6P4I2	378 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PDPN	Q86YL7	162 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	LYZL4	Q96KX0	146 aa		6.88	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	ODAM	A1E959	279 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	FOSL1	P15407	271 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR10J1	P30954	320 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	SSTR5	P35346	364 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193		Q56UQ5	140 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	FAM209B	Q5JX69	171 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	FADS6	Q8N9I5	356 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	NOTCH4	Q99466	2003 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	MARCH11	A6NNE9	402 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF785	A8K8V0	405 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	HTR1D	P28221	377 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PLAUR	Q03405	335 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	HIST3H3	Q16695	136 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	SMIM8	Q96KF7	97 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193		M0R143	59 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	RAB29	O14966	203 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	UMOD	P07911	640 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	COX5B	P10606	129 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	UCP1	P25874	307 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	SPCS3	P61009	180 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR8G5	Q8NG78	346 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	C5orf63	A6NC05	138 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PLAU	P00749	431 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	TRGC1	P0CF51	173 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PRRX1	P54821	245 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	USF3	Q68DE3	2245 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193		K7ESF4	209 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	MFAP2	P55001	183 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PKIA	P61925	76 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	TBX15	Q96SF7	602 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	PARL	Q9H300	379 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		6.86	□□□□□ -1.31
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		6.86	□□□□□ -1.31

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