RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 C22orf46C9J442 243 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PET100P0DJ07 73 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SMCO1Q147U7 214 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 NRGNQ92686 78 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SPIN2AQ99865 258 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 POMT1Q9Y6A1 747 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GU03 582 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV4-39P01824 125 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 RPL12P30050 165 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 GNB2P62879 340 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF383Q8NA42 475 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 DDB2Q92466 427 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf1Q9H5F2 150 aa12.55□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 J3QR06 171 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CHST1O43916 411 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SSSCA1O60232 199 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SPDEFO95238 335 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 P0C879 139 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CT45A6P0DMU7 189 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CT45A5P0DMU8 189 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CT45A7P0DMV0 189 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 C4BPBP20851 252 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 COL8A1P27658 744 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM30BQ3MIR4 351 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ESCO2Q56NI9 601 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 FAM216AQ8WUB2 273 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 AQP10Q96PS8 301 aa12.54□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 E5RGE8 158 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 GPR37O15354 613 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 BCL2L11O43521 198 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM50AO95807 157 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SSX9Q7RTT3 188 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD12Q8N2K0 398 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 S1PR3Q99500 378 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CCL19Q99731 98 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CYTL1Q9NRR1 136 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 NSG2Q9Y328 171 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 MMP24Q9Y5R2 645 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 FAM24AA6NFZ4 105 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 F5H0A9 414 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A6P12236 298 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 REG1BP48304 166 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ARF6P62330 175 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 NHLH2Q02577 135 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF767PQ75MW2 155 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 LY6G5BQ8NDX9 201 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 R3HDM4Q96D70 268 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ARPC5LQ9BPX5 153 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM133Q9H2Q1 129 aa12.53□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CELSR2Q9HCU4 2923 aa12.52□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 CSMD2Q7Z408 3487 aa12.52□□□□□ -0.4
CASQ1-201ENST00000368078 HPRT1P00492 218 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 HTR2BP41595 481 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PAX9P55771 341 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 MIDNQ504T8 468 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ALKAL2Q6UX46 152 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SLC51BQ86UW2 128 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 OR8H3Q8N146 312 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 C8orf46Q8TAG6 207 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SMIM3Q9BZL3 60 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ONECUT1Q9UBC0 465 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SESN1Q9Y6P5 492 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CENPEQ02224 2701 aa12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 A0A087X0M5 115 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GX30 115 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 MARCH11A6NNE9 402 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 GOSR1O95249 250 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 Q8N7P7 452 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 OR10X1Q8NGY0 326 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF596Q8TC21 504 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CD300LFQ8TDQ1 290 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ST8SIA2Q92186 375 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZFP57Q9NU63 452 aa12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms