RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488550.5

MEIS1-209, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS1, Length 5,111 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM50AO95807 157 aa6.55□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.55□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 DLX6P56179 175 aa6.55□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.55□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 NRAPQ86VF7 1730 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 A0A1B0GTH9 108 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SFTPCP11686 197 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 CTSSP25774 331 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 VSTM2LQ96N03 204 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 J3QW42 95 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 FGF16O43320 207 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 ESDP10768 282 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 H2BFSP57053 126 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 RHOGP84095 191 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF683Q8IZ20 524 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 F8VVB4 439 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 F8VWA3 439 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 K7N7A8 449 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 CKS1BP61024 79 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 METTL26Q96S19 204 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 USP54Q70EL1 1684 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 RRHO14718 337 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 APOMO95445 188 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 WNT5AP41221 380 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 RUNX1Q01196 453 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SSPNQ14714 243 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 NUP37Q8NFH4 326 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 FAM222BQ8WU58 562 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 JPT1Q9UK76 154 aa6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 ABCA3Q99758 1704 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 A8MWV9 139 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 H7C2G1 150 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 MGST3O14880 152 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 TBR1Q16650 682 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 OR4A5Q8NH83 315 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 GPR82Q96P67 336 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 A0A1W2PRS3 328 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 COX5BP10606 129 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 NUBP1P53384 320 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 TCTN1Q2MV58 587 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 C2orf83Q53S99 150 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 COX14Q96I36 57 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 LMO7DNF2Z398 122 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 ERGP11308 486 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 CX3CL1P78423 397 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 DEFB103AP81534 67 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 PGPA6NDG6 321 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 ERVK11-1P61568 191 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.53□□□□□ -1.36
MEIS1-209ENST00000488550 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 211.4 ms