RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CIDEAO60543 219 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SSX8Q7RTT4 187 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 FGFRL1Q8N441 504 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR2A4O95047 310 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR2A7Q96R45 310 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM189A5PLL7 270 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 H3BVH4 76 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SULT1A2P50226 295 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 RND2P52198 227 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SEC16AO15027 2179 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ODAMA1E959 279 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 HOXA6P31267 233 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SHISA5Q8N114 240 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 BCL2P10415 239 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 GLIPR1P48060 266 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 GPR146Q96CH1 333 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CRYBA2P53672 197 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 MC5RP33032 325 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 IGKV3-11P04433 115 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ID4P47928 161 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 P2RY4P51582 365 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 FHL5Q5TD97 284 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 A0A087X0M5 115 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1B0GX30 115 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF345Q14585 488 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 STPG2Q8N412 459 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SGK494Q96LW2 274 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 GPR132Q9UNW8 380 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 METTL26Q96S19 204 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SVILO95425 2214 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PGPA6NDG6 321 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 M0R3E3 92 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CD1AP06126 327 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 KLK2P20151 261 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ATP5J2P56134 94 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 UBE2V2Q15819 145 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF383Q8NA42 475 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PIN1P1O15428 100 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CELA3AP09093 270 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 NMUP48645 174 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SMIM10Q96HG1 83 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SPSB2Q99619 263 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ZG16O60844 167 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ISG15P05161 165 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 DLL1O00548 723 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 COX19Q49B96 90 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 CALHM1Q8IU99 346 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 OR4C12Q96R67 309 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRF-209ENST00000438120 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms