RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPTA1P02549 2419 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 H0Y980 276 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 GFRALQ6UXV0 394 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ITPR1Q14643 2758 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 H3BP45 60 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAMP3O60896 148 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV1-5P01602 117 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRDX2P32119 198 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CAV2P51636 162 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CLINT1Q14677 625 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMIM8Q96KF7 97 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 K7ENP7 123 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CST7O76096 145 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SFTA3P0C7M3 94 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF616Q08AN1 781 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 UQCC3Q6UW78 93 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SVBPQ8N300 66 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 FGFRL1Q8N441 504 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2D2Q9H210 308 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHST1O43916 411 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPR137BO60478 399 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERPINE2P07093 398 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 VDAC1P21796 283 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD40P25942 277 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 IL2RGP31785 369 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 GLRXP35754 106 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 PAX9P55771 341 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 NHLH1Q02575 133 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRRG2O14669 202 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF737O75373 536 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 THBDP07204 575 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 AKR1D1P51857 326 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 BTNL8Q6UX41 500 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2C3Q8N628 320 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRRM5B3KS81 715 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLA2G5P39877 138 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD200P41217 278 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 P2RY1P47900 373 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SULT1A2P50226 295 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPT1P50897 306 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRPXP78539 464 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ID3Q02535 119 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZFP82Q8N141 532 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 GALMQ96C23 342 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAXQ9Y2V3 346 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 POLEQ07864 2286 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 DPRXA6NFQ7 191 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAAR5O14804 337 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 MIDNQ504T8 468 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRR7Q8TB68 274 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CACNG5Q9UF02 275 aa8.47□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.46□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 OOEPA6NGQ2 149 aa8.46□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 WRBO00258 174 aa8.46□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 GFRA3O60609 400 aa8.46□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 PITX3O75364 302 aa8.46□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV1-46P01743 117 aa8.46□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CASP6P55212 293 aa8.46□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CCNDBP1-210ENST00000566882 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms